細菌溶解產物膠囊的服用方法分為幾個階段。首先是用于預防以及鞏固治療時，患者應每天空腹口服一粒，每月10天，連續3個月為一個療程。即連續服用10天，停止服用20天；再服用10天，停止服用20天；再服用10天。
細菌溶解產物膠囊用于急性治療時，患者應每天空腹口服一次，每次一粒，直到癥狀消失，但至少需要服用10天。如果需要抗生素，最好從治療開始同時服用。
細菌溶解產物膠囊用于6個月至12歲兒童時，需要服用兒童規格膠囊。因為每個兒童規格膠囊的活性成分含量是成人規格膠囊的一半。當兒童患者如果吞咽膠囊困難時，可以打開膠囊，并將其添加到飲料中，比如果汁、牛奶等，但需要注意的是，這一藥物不能添加到碳酸或咖啡因飲料中。但應注意不良反應，比如有持續胃腸紊亂或長時間持續的皮膚反應和呼吸問題。
這一藥物是從細菌體內提取出來的，經過滅活的，可以刺激人體產生對細菌的抵抗力，這個藥是很安全的，也沒有明顯副作用，可以提高人體對細菌的抵抗力。細菌溶解產物膠囊在使用的時候需要注意，對于自身免疫性疾病患者以及急性腸道感染的患者、有過敏史，以及小于一歲的兒童是禁止使用的。
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